Sus especies

Las especies de Esteros de Farrapos se encuentran representadas por los diferentes órdenes como ser:

•      14 Especies de anfibios entre las que se destacan los sapos Buffo granulossus, B. Paracnemis, las ranas Hyla pulchella, Leptodactilus gracilis, y L. Ocellatus, los reptiles Tupinambis merianae (lagarto) y la tortuga Phrynops hilarii.
•     104 Especies de aves, entre las cuales se destacan la garza gran Egretta alba, la garza blanca chica Egretta thula, el buitre de cabeza roja Cathartes aura, la  cigüeña común Ciconia maguari, el chajá la pava de monte Penelope obscura, la polla de agua Gallinuka chloropus, el tero real Himantopus melanurus, varias especies de Anatidos , lzas especies de Martín pescador y Carpinteros como Colaptes campestris, Colaptes melanolaimus.
•    15 Especies de mamíferos entre los cuales se destacan el carpincho Hydrocoerus hydrochaeris, el zorro de monte Cerdocyon thous, los murciélagos Myotis riparius, Eptesicus brasiliensis.
•     Numerosas especies de peces entre los cuales se destacan diversas especies de interés comercial como integrantes de la familia Pimelodidae (bagres), Bagre porteño: Parapimelodus valenciennis, Bagre blanco: Pimelodus albicans, Bagre amarillo: Pimelodus maculatus Bagre sapo, negro, Rhamdia quelen, Dorado: Salminus maxillosus, Boga Leporinus obtusidens, Tararira: Hoplias malabaricus, Surubí Pseudoplatystoma coruscans, Patí: Luciopimelodus pati.